Sette anni dopo gli straordinari fatti raccontati in Donnie Darko, strani ed inspiegabili avvenimenti tornano a turbare la vita di Samantha, la più giovane sorella di Donnie.
Una nuova inquietante profezia, una serie inquietante di eventi che sconvolgono lo spazio-tempo e il ritorno del coniglio Frank per annunciare un nuovo conto alla rovescia prima della fine del mondo. 4 giorni, 17 ore, 26 minuti e 31 secondi
il destino del mondo sarà nelle mani di Samantha.
Lo sceneggiatore e regista di Donnie Darko Richard Kelly ha ideato un elaborato sistema di convenzioni che formano le basi per gli eventi narrati nella pellicola. In seguito, ha creato un testo chiamato La filosofia del viaggio nel tempo scritto dallautrice fittizia Roberta Sparrow per spiegare alcuni di questi fenomeni. I creatori di S. DARKO hanno seguito le direttive di Kelly, ma hanno anche ripensato ad alcuni degli elementi caratteristici che circondano il primo film per produrre una sceneggiatura che fosse una continuazione di quella storia e allo stesso tempo rappresentasse una saga interamente nuova. Sia in Donnie Darko che in S. DARKO, lazione parte con la formazione dellUniverso Tangente. Secondo La filosofia del viaggio nel tempo, nonostante il tempo sia generalmente stabile, talvolta viene modificato per ragioni che rimangono misteriose. Questa influenza crea un Universo Tangente o una realtà alternativa parallela allUniverso Primario in cui viviamo.